ŠZŠ pre žiakov s TP vznikla 1. septembra 1993 pri vtedajšom ÚSS pre telesne a mentálne postihnuté deti a mládež (v súčasnosti DSS). Poskytovala vzdelanie 15 deťom DSS v 3 triedach so spojenými ročníkmi. V tom istom roku bola po prvý krát otvorená trieda pomocnej školy (variant B) pre deti, ktoré boli v minulosti oslobodzované od povinnej školskej dochádzky.

Od januára 1999 škola pracuje ako právny subjekt.

V súčasnosti škola poskytuje vzdelanie žiakov, ktorí sú zaradení do tried podľa druhu a stupňa postihnutia vo variantoch A, B, C, autistickej triede a v triede pre viacnásobne postihnutých. Škola prešla rôznymi zmenami a v súčasnosti sa vzdelávajú žiaci podľa druhu a stupňa MP a TP podľa vzdelávacích programov: